广岛吴市的便利店里，冰淇淋在-18℃的冰柜里却像融化的果冻。高一新生藤原悠斗，在“秘密教学”APP的诱惑下，开始了看似普通的学习生活。但手机相册里，却莫名多出横滨港的蓝光照片，他从未去过那里。周一在生物课上看到的奇怪生物发光现象，周二又出现在数学老师的袖口上，那是一种熟悉的腐木味。悠斗发现，自动铅笔的笔芯永远用不完，而“克莱因瓶式时空结构”似乎是这一切的钥匙。他开始怀疑，这所学校，以及“免费阅读”的APP，隐藏着什么秘密？为什么他总觉得，自己遗漏了什么重要的记忆？（第3话，主角忘记了自己曾经在APP上购买过会员，导致剧情线出现偏差。伏笔：悠斗的爷爷是位研究记忆的科学家，以及APP的开发者似乎与悠斗的爷爷有某种联系。）
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